Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms