Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms