Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms