Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms