Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms