Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms