Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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LAMA3Q16787 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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LAMA3Q16787 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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LAMA3Q16787 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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