Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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