Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms