Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms