Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms