Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRAP54198 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRAP54198 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRAP54198 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRAP54198 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms