Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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