Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL2P13500 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL2P13500 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms