Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RARBP10826 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARBP10826 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARBP10826 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARBP10826 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARBP10826 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms