Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC3O60481 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms