Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPLO60437 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPLO60437 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPLO60437 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPLO60437 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPLO60437 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPLO60437 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPLO60437 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms