Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
OPN4Q9UHM6 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.7 ms