Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
LONRF1Q17RB8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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LONRF1Q17RB8 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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