| UPP1 | Q16831 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA1B-201 | ENST00000362535 | 133 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.64-201 | ENST00000362845 | 102 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4-80P-201 | ENST00000363200 | 141 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-770P-201 | ENST00000363929 | 105 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA25.9-201 | ENST00000365087 | 128 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1160P-201 | ENST00000384546 | 104 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR606-201 | ENST00000384851 | 96 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR215-201 | ENST00000384858 | 110 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL135790.2-201 | ENST00000437701 | 267 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | JTBP1-201 | ENST00000441314 | 247 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPS4XP11-201 | ENST00000446897 | 772 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC099513.1-201 | ENST00000490423 | 301 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGN1P7-201 | ENST00000491722 | 313 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-496P-201 | ENST00000516145 | 99 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU2-56P-201 | ENST00000516826 | 190 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC021506.2-201 | ENST00000612354 | 169 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
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| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.152-201 | ENST00000363578 | 100 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.276-201 | ENST00000364732 | 109 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.422-201 | ENST00000384054 | 114 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC108516.1-201 | ENST00000503666 | 257 nt | TSL 2 BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-341P-201 | ENST00000516973 | 96 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL442663.2-201 | ENST00000554385 | 511 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC068338.1-201 | ENST00000565567 | 176 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR6078-201 | ENST00000611069 | 100 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF260-205 | ENST00000593142 | 4047 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | FABP12-201 | ENST00000360464 | 551 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4-90P-201 | ENST00000362773 | 141 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | snoU2_19.2-201 | ENST00000363024 | 80 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.265-201 | ENST00000364677 | 108 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.341-201 | ENST00000365341 | 102 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.418-201 | ENST00000384029 | 102 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR499A-201 | ENST00000384903 | 122 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.581-201 | ENST00000391017 | 97 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-710P-201 | ENST00000410424 | 105 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-955P-201 | ENST00000410497 | 104 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.621-201 | ENST00000411065 | 96 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | FTH1P12-201 | ENST00000432137 | 551 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL353743.2-204 | ENST00000456242 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP003733.2-201 | ENST00000529409 | 171 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP002004.2-201 | ENST00000531656 | 154 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC091895.1-201 | ENST00000624494 | 256 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| UPP1 | Q16831 | ABCA5-201 | ENST00000392676 | 8220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.222-201 | ENST00000364264 | 102 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA63C-201 | ENST00000364578 | 129 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1080P-201 | ENST00000383982 | 107 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.512-201 | ENST00000384518 | 102 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.541-201 | ENST00000384640 | 113 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR1276-201 | ENST00000408707 | 83 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC024067.1-201 | ENST00000426199 | 223 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | DYNLT3P2-201 | ENST00000442517 | 295 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.720-201 | ENST00000517166 | 92 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA77B-201 | ENST00000578179 | 125 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR8063-201 | ENST00000621930 | 81 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC068647.2-201 | ENST00000637380 | 353 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | HFM1-201 | ENST00000370425 | 4931 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | KLRA1P-203 | ENST00000535939 | 2353 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LRRD1-203 | ENST00000430130 | 2661 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | BRCA1-202 | ENST00000354071 | 4497 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.310-201 | ENST00000365063 | 113 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-290P-201 | ENST00000365212 | 101 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR562-201 | ENST00000384894 | 95 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL034345.1-201 | ENST00000407768 | 123 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL161935.2-201 | ENST00000414627 | 60 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL731563.1-201 | ENST00000442202 | 214 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | HSPE1P24-201 | ENST00000450782 | 238 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | snoU13.9-201 | ENST00000458927 | 103 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGN1P10-201 | ENST00000474557 | 553 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CFLAR-AS1-202 | ENST00000474886 | 223 nt | TSL 3 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4ATAC11P-201 | ENST00000515939 | 126 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-635P-201 | ENST00000516651 | 102 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-570P-201 | ENST00000517051 | 105 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | IGLVVI-22-1-201 | ENST00000521183 | 211 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC090124.1-201 | ENST00000525097 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC107973.1-201 | ENST00000530249 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC011604.1-201 | ENST00000545978 | 196 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC008737.2-201 | ENST00000599446 | 118 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC005972.2-201 | ENST00000604690 | 348 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OSBPL1A-217 | ENST00000638614 | 84 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ICE2P2-201 | ENST00000483823 | 2787 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.16-201 | ENST00000362421 | 102 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1048P-201 | ENST00000364054 | 107 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.368-201 | ENST00000365547 | 113 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.456-201 | ENST00000384232 | 111 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.569-201 | ENST00000384749 | 103 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR194-1-201 | ENST00000384892 | 85 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6ATAC2P-201 | ENST00000387943 | 126 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6ATAC19P-201 | ENST00000408096 | 110 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL590705.2-201 | ENST00000420204 | 281 nt | TSL 5 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |