Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPROQ16827 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPROQ16827 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPROQ16827 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPROQ16827 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPROQ16827 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPROQ16827 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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