Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTN1Q16799 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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