Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SMN1Q16637 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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