Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTF1Q16619 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTF1Q16619 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms