Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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