Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HMGN3Q15651 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms