Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SKIV2LQ15477 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SKIV2LQ15477 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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