Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PUM3Q15397 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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