Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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