Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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