Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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NR1I3Q14994 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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NR1I3Q14994 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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