Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ODF1Q14990 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ODF1Q14990 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms