Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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RAB39AQ14964 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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RAB39AQ14964 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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