Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms