Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RBM39Q14498 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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