| RUNX2 | Q13950 | WWP1P1-201 | ENST00000466609 | 2769 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CHST9-202 | ENST00000581714 | 2043 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC134026.1-201 | ENST00000623249 | 2239 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX15-203 | ENST00000638951 | 11341 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR4C11-202 | ENST00000641580 | 2737 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.14-201 | ENST00000362415 | 103 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.288-201 | ENST00000364854 | 92 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-514P-201 | ENST00000384208 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-950P-201 | ENST00000384651 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-651P-201 | ENST00000411040 | 105 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1132P-201 | ENST00000459214 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117454.1-201 | ENST00000491120 | 168 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358944.1-201 | ENST00000528537 | 144 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011604.1-201 | ENST00000545978 | 196 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC127455.1-201 | ENST00000565496 | 145 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4643-201 | ENST00000577473 | 78 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3935-201 | ENST00000583472 | 104 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512605.2-201 | ENST00000592972 | 256 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL008718.3-201 | ENST00000610217 | 321 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021506.2-201 | ENST00000612354 | 169 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR8074-201 | ENST00000615081 | 81 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548AY-201 | ENST00000617669 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNQ1OT1_5.1-201 | ENST00000621902 | 226 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC095038.3-201 | ENST00000634439 | 195 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIAA1551-201 | ENST00000312561 | 6230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ASPN-202 | ENST00000375544 | 2470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011604.2-202 | ENST00000540229 | 2451 nt | APPRIS P5 TSL 2 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.44-201 | ENST00000362676 | 108 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.117-201 | ENST00000363294 | 101 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-13P-201 | ENST00000364019 | 141 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-740P-201 | ENST00000364734 | 105 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1080P-201 | ENST00000383982 | 107 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-203P-201 | ENST00000384038 | 104 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA72-201 | ENST00000384339 | 132 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1031P-201 | ENST00000384773 | 107 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR9-3-201 | ENST00000385084 | 90 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR30A-201 | ENST00000385092 | 71 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUMO2P12-201 | ENST00000405924 | 140 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP489-201 | ENST00000410986 | 109 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161935.2-201 | ENST00000414627 | 60 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P11-201 | ENST00000496507 | 171 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107393.1-201 | ENST00000512403 | 346 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.680-201 | ENST00000516441 | 93 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002004.2-201 | ENST00000531656 | 154 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC036222.2-201 | ENST00000579033 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | POLR3GP1-201 | ENST00000594073 | 261 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CERS6-AS1-202 | ENST00000594898 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA16.1-201 | ENST00000364597 | 132 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-702P-201 | ENST00000364982 | 107 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1289P-201 | ENST00000384431 | 106 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR583-201 | ENST00000384846 | 75 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR194-1-201 | ENST00000384892 | 85 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ39-201 | ENST00000390498 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL603910.2-201 | ENST00000407268 | 136 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136985.1-201 | ENST00000424592 | 395 nt | TSL 3 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | JTBP1-201 | ENST00000441314 | 247 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC233266.1-201 | ENST00000454518 | 96 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL583859.1-201 | ENST00000455871 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P23-201 | ENST00000456759 | 269 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR9P1P-201 | ENST00000496431 | 281 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008834.1-201 | ENST00000511612 | 175 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4709-201 | ENST00000577272 | 72 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA77B-201 | ENST00000578179 | 125 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005357.1-201 | ENST00000588399 | 301 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC062037.2-201 | ENST00000610137 | 73 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC242852.1-201 | ENST00000612151 | 96 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU18.1-201 | ENST00000629629 | 71 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NAA50-211 | ENST00000630058 | 177 nt | TSL 5 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XIRP2-201 | ENST00000295237 | 5246 nt | TSL 2 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRIQ3-204 | ENST00000395089 | 2673 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-414P-201 | ENST00000363705 | 104 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR562-201 | ENST00000384894 | 95 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR764-201 | ENST00000390811 | 85 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P33-201 | ENST00000402100 | 465 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTF3P11-201 | ENST00000426582 | 477 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z98949.2-201 | ENST00000440996 | 144 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STAG3L5P-204 | ENST00000443759 | 179 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD2.1-201 | ENST00000458762 | 69 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-295P-201 | ENST00000516901 | 104 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-116P-201 | ENST00000516940 | 62 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CARD18-203 | ENST00000532895 | 422 nt | TSL 2 BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC013791.1-201 | ENST00000616619 | 62 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP99-201 | ENST00000364020 | 114 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-41P-201 | ENST00000364426 | 143 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.352-201 | ENST00000365439 | 102 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.2-201 | ENST00000391293 | 112 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP200-201 | ENST00000410564 | 320 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | COX6CP10-201 | ENST00000416832 | 224 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353743.2-204 | ENST00000456242 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-34P-201 | ENST00000459394 | 64 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP458-201 | ENST00000516188 | 119 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-56P-201 | ENST00000516826 | 190 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4419B-201 | ENST00000577260 | 68 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6845-201 | ENST00000613182 | 61 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068733.3-201 | ENST00000632757 | 269 nt | TSL 3 BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIF1A-212 | ENST00000557538 | 3468 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FSIP2-202 | ENST00000424728 | 20788 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIRLET7C-201 | ENST00000362160 | 84 nt | BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |