Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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