Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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