Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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