| MPP3 | Q13368 | RNU6-674P-201 | ENST00000363831 | 107 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU4-41P-201 | ENST00000364426 | 143 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-301P-201 | ENST00000384277 | 107 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU4-43P-201 | ENST00000410628 | 137 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL513185.1-201 | ENST00000431638 | 162 nt | TSL 5 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPS4XP11-201 | ENST00000446897 | 772 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1234P-201 | ENST00000516877 | 103 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR4438-201 | ENST00000585271 | 93 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL049861.1-201 | ENST00000603130 | 150 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | SLITRK6-201 | ENST00000400286 | 4318 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | SENP7-206 | ENST00000394094 | 4703 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | OR8K3-204 | ENST00000641689 | 2380 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZBTB6-201 | ENST00000373659 | 4106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC011124.2-201 | ENST00000518739 | 3222 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.71-201 | ENST00000362892 | 104 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU4-13P-201 | ENST00000364019 | 141 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1336P-201 | ENST00000383886 | 109 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNY3P5-201 | ENST00000384127 | 102 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.521-201 | ENST00000384560 | 114 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| MPP3 | Q13368 | RN7SL636P-201 | ENST00000497504 | 294 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC093259.1-201 | ENST00000509755 | 300 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC097462.1-201 | ENST00000514125 | 324 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| MPP3 | Q13368 | MIR5007-201 | ENST00000583098 | 95 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC046143.2-201 | ENST00000609789 | 160 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR6844-201 | ENST00000637122 | 62 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | CHORDC1-205 | ENST00000529726 | 4805 nt | TSL 2 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC009487.4-201 | ENST00000624969 | 3585 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1082P-201 | ENST00000364574 | 107 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.332-201 | ENST00000365271 | 113 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.393-201 | ENST00000383936 | 102 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA72-201 | ENST00000384339 | 132 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | HMGN2P39-201 | ENST00000398005 | 273 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR1262-201 | ENST00000408276 | 93 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC123900.1-201 | ENST00000420390 | 96 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPS27P1-201 | ENST00000450552 | 247 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPS27P21-201 | ENST00000486977 | 252 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU7-172P-201 | ENST00000517125 | 64 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA31.25-201 | ENST00000517242 | 134 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR4448-201 | ENST00000584360 | 86 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC120024.3-201 | ENST00000603167 | 156 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | USP53-202 | ENST00000450251 | 6072 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | TTK-202 | ENST00000369798 | 3010 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.251-201 | ENST00000364551 | 99 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-484P-201 | ENST00000384016 | 107 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD23.1-201 | ENST00000408212 | 104 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC060773.1-201 | ENST00000421698 | 310 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPS15AP28-201 | ENST00000435088 | 386 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC008267.6-201 | ENST00000441664 | 139 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL357134.1-201 | ENST00000445848 | 426 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1333P-201 | ENST00000516162 | 93 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-856P-201 | ENST00000516959 | 98 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC004148.1-201 | ENST00000571506 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR3646-201 | ENST00000578301 | 84 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | U2.20-201 | ENST00000613956 | 192 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZCCHC10-202 | ENST00000355372 | 2160 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.127-201 | ENST00000363386 | 109 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC008852.1-201 | ENST00000510198 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | IGHVIII-5-1-201 | ENST00000523059 | 99 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL23AP91-201 | ENST00000569211 | 455 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR4672-201 | ENST00000583126 | 81 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR6766-201 | ENST00000622641 | 72 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA15.3-201 | ENST00000626315 | 122 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA4.1-201 | ENST00000628597 | 123 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.203-201 | ENST00000364106 | 102 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP205-201 | ENST00000364653 | 136 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD50B-201 | ENST00000364995 | 70 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD116-14-201 | ENST00000383894 | 92 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD116-17-201 | ENST00000383929 | 92 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD116-15-201 | ENST00000384445 | 92 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA67.4-201 | ENST00000384688 | 142 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD116-19-201 | ENST00000384729 | 92 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR378D2-201 | ENST00000580636 | 98 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | U6.73-201 | ENST00000619194 | 103 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | CENPQ-201 | ENST00000335783 | 1733 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | KPNA5-202 | ENST00000368564 | 11311 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD115-3-201 | ENST00000363100 | 82 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.796-201 | ENST00000364268 | 102 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.799-201 | ENST00000364992 | 102 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR634-201 | ENST00000385208 | 97 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA75.5-201 | ENST00000391291 | 81 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | RN7SKP284-201 | ENST00000411002 | 343 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | HMGN2P34-201 | ENST00000437647 | 269 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD11-201 | ENST00000459124 | 84 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-197P-201 | ENST00000516680 | 100 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU2-56P-201 | ENST00000516826 | 190 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC011604.1-201 | ENST00000545978 | 196 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC002984.1-201 | ENST00000591692 | 448 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL160408.5-201 | ENST00000607759 | 526 nt | TSL 4 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |