Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCGQ13326 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCGQ13326 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms