| PTK7 | Q13308 | MTND5P34-201 | ENST00000568888 | 325 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR3169-201 | ENST00000578032 | 83 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | GNAI3-201 | ENST00000369851 | 27174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD115-3-201 | ENST00000363100 | 82 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD14E-201 | ENST00000364009 | 85 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-309P-201 | ENST00000364573 | 106 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-851P-201 | ENST00000384565 | 107 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL365277.2-201 | ENST00000415255 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC110009.1-201 | ENST00000512965 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC245166.1-201 | ENST00000521012 | 253 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR3126-201 | ENST00000577443 | 74 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL022345.2-201 | ENST00000606307 | 135 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | DNAH12-208 | ENST00000495027 | 12146 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | BCLAF1-205 | ENST00000527536 | 5371 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SYNE2-212 | ENST00000554584 | 20508 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1164P-201 | ENST00000364428 | 107 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-442P-201 | ENST00000383968 | 104 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP482-201 | ENST00000391269 | 118 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RPL32P35-201 | ENST00000415214 | 394 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC245047.3-201 | ENST00000429428 | 127 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC234781.5-202 | ENST00000453508 | 426 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
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| PTK7 | Q13308 | OR2L2-203 | ENST00000642011 | 4225 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL136360.1-201 | ENST00000503377 | 1900 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC096644.4-201 | ENST00000563417 | 2912 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SIRT1-202 | ENST00000403579 | 3333 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | PIK3C2G-202 | ENST00000433979 | 4840 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.265-201 | ENST00000364677 | 108 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-91P-201 | ENST00000364746 | 163 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | snoU2-30.1-201 | ENST00000365012 | 70 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA40.5-201 | ENST00000391061 | 128 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP492-201 | ENST00000411330 | 114 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL429P-201 | ENST00000479090 | 223 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL489P-201 | ENST00000486185 | 223 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL327P-201 | ENST00000488659 | 223 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | IGHVIII-67-2-201 | ENST00000519849 | 88 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC107016.2-201 | ENST00000547968 | 190 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
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| PTK7 | Q13308 | MIR6129-201 | ENST00000616087 | 109 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL853P-201 | ENST00000617250 | 223 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZMYM1-201 | ENST00000359858 | 4175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA38-201 | ENST00000363946 | 132 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD56.5-201 | ENST00000364281 | 72 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | MME-216 | ENST00000615825 | 5523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-58P-201 | ENST00000362413 | 163 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | U8.5-201 | ENST00000364528 | 136 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD58C-201 | ENST00000365223 | 64 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.346-201 | ENST00000365385 | 112 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.617-201 | ENST00000410920 | 90 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC091133.1-201 | ENST00000435491 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SKP132-201 | ENST00000516001 | 208 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL670379.3-201 | ENST00000605040 | 251 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | Hammerhead_HH9.1-201 | ENST00000616606 | 77 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | FRS2-201 | ENST00000397997 | 6550 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | EFR3A-202 | ENST00000519656 | 5247 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | MTND5P32-201 | ENST00000560711 | 1802 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | CEP44-203 | ENST00000426172 | 3037 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-301P-201 | ENST00000384277 | 107 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR887-201 | ENST00000401258 | 79 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP184-201 | ENST00000411071 | 108 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC099677.2-201 | ENST00000436385 | 175 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL021397.1-201 | ENST00000451806 | 248 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR4319-201 | ENST00000577285 | 85 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC079466.2-201 | ENST00000585394 | 185 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | 5S_rRNA.11-201 | ENST00000618635 | 84 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | HIF1A-212 | ENST00000557538 | 3468 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | CLLU1-201 | ENST00000378485 | 3897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP126-201 | ENST00000365092 | 109 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-429P-201 | ENST00000384582 | 108 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR548A3-201 | ENST00000385297 | 97 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RPL21P3-201 | ENST00000395517 | 478 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL590705.2-201 | ENST00000420204 | 281 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC00407-201 | ENST00000426509 | 295 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | KRTAP19-11P-201 | ENST00000439851 | 104 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC02041-201 | ENST00000440726 | 246 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC069257.2-201 | ENST00000441819 | 155 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | UBBP3-201 | ENST00000445497 | 241 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-26P-201 | ENST00000458980 | 63 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-113P-201 | ENST00000516653 | 101 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC006441.5-201 | ENST00000612680 | 209 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC134878.1-201 | ENST00000619901 | 243 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC025539.1-201 | ENST00000515343 | 4019 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | TSGA10-205 | ENST00000410001 | 3036 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL445259.1-201 | ENST00000587106 | 2984 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRDN-201 | ENST00000334268 | 4770 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |