Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRIM28Q13263 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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