Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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