Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KCNMA1Q12791 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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