Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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RABGGTBP53611 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGGTBP53611 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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RABGGTBP53611 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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RABGGTBP53611 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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RABGGTBP53611 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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