Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H7C1Q1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H7C1Q1 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H7C1Q1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H7C1Q1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
H7C1Q1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
H7C1Q1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
H7C1Q1 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms