Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
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LTBP3Q9NS15 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LTBP3Q9NS15 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LTBP3Q9NS15 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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