Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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