Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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